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也同往相助。双方大战于东台山（今河北张家口市涿鹿县小五台山一带），轩辕军大败，向北退却。夸父、共工两族自告奋勇跟踪追击，一直追到玉邦河（今桑干河）以北。轩辕氏大酋长姬邦卉见蚩尤军主力没有追来，便率军反击追兵，在玉泉（今山西大同市天镇县）击败了夸父和共工的军队。夸父、共工残部在败退途中，又遭到了炎帝姜榆罔的截杀，再次兵败，幸亏此时蚩尤率主力赶到，姜榆罔这才退兵。
蚩尤十四年（乙未，前4526），轩辕氏大酋长姬邦卉联合东夷少昊部和开发、共工部，再次向九黎蚩尤氏统治区发动进攻。大军驻扎在阪泉以北的涿鹿旷野。蚩尤自率本部精兵出阪泉城，在城北的旷野扎营，与轩辕军对峙。于是，中国历史上第一次大规模的战争在涿鹿暴发了。这场战争一直持续了三年，轩辕军前后共发动了九次大的进攻，都被勇猛的蚩尤军击败。
蚩尤十七年（戊戌，前4523），轩辕氏与蚩尤氏谈判言和，双方以玉邦河为界，河南归蚩尤氏政权，河北归轩辕氏政权。
轩辕氏和蚩尤氏停战后，轩辕氏大酋长姬邦卉为了击败蚩尤，把军队和部族的管理权交给亲信大臣，独自前往博望山（今安徽马鞍山市当涂县西南东梁山）拜师学道，学习战略战术，苦学三年，终于掌握了许多出奇制胜的战术。于是他下山回国，以自己所学重新组织训练军队，使军队能力大增。又经过了三年的实战训练，终于建成了一支具有强大战斗力的军队。于是，姬邦卉认为时机已经成熟，便再次发动了涿鹿之战。
蚩尤二十四年（乙巳，前4516），轩辕氏大酋长姬邦卉联合炎帝神农氏同时出兵，向冀州九黎蚩尤氏的首都发起进攻。蚩尤大怒，认为姬邦卉是一个言而无信的小人，一面使人约东夷少昊部和魁隗氏后裔夸父、共工部前来助战，一面调集八十一部落的弟兄列阵迎敌，双方在涿鹿旷野再次展开恶战。
关于这场战争，历史上有多种神话传说。有一种说法是：蚩尤神通广大，他以武力击败八任炎帝姜榆罔，然后自称炎帝，立都于阪泉。炎帝姜榆罔请有熊轩辕氏出兵讨伐蚩尤，双方战于涿鹿之野。蚩尤军金盔金甲，手执金刀金矛，作战十分勇猛。轩辕军用六种凶猛的神兽与蚩尤军作战，冲乱了对方的阵地，乘机打败对方。这里所说的六种神兽，实际上是轩辕氏部下的六大氏族，他们分别以熊、虎、罴、貅、貔、?为图腾，是六支战斗力极强的队伍。
“黄帝”苦修三年，学会了玄女兵法后，再次出兵攻打阪泉。此次六军齐出，以闪电般战术攻入蚩尤军中，蚩尤军措手不及被打的大败。蚩尤大惊，急忙请他的好朋友风伯和雨师前来助战。刹那间狂风大作，电闪雷鸣，暴雨倾盆，天昏地暗，紧接着漫山遍野都是茫茫大雾。轩辕军辨不清东南西北，立刻混乱起来。“黄帝”急忙请旱神女魃前来帮忙，止住了风雨雷电，再次打败了蚩尤军。蚩尤兵败弃城逃跑，“黄帝”用指南车指引方向，从后边紧追，最后终于捉住了蚩尤，将他处死。（参考《山海经，大荒北经》、《太平御览》等综述）。
而另一种说法是：“黄帝攻蚩尤，三年城不下，募求术士，乃得武胥。……五军已具，四面攻蚩尤，三日其城果下。”（《太平御览》卷三二八引《玄女兵法》）轩辕军连续三年不能战胜蚩尤军，“黄帝”这才认识到自己缺少指挥作战的能力，于是寻访贤士，拜精通兵法的伍胥为军师，用诡诈的计谋蒙骗了蚩尤，最后将他击败。
史书中的黄帝是一个神话帝王，司马迁把黄帝政权几百年的时间全加在“黄帝”一人身上，让他活了一百五十多岁，这是十分荒唐的。其实，历史上真正与蚩尤大战的并非黄帝，而是黄帝的父亲姬邦卉。
最后一次涿鹿之战正值夏日的雨季，姬邦卉见蚩尤城正处于灵山河谷的山口处，便命应龙带着数百人绕道进入灵山河谷的上游，垒石筑坝，蓄积灵山河水。蚩尤闻灵山河水减少，心生疑惑，使人往上游察看。察看的士兵中途遭到了轩辕军的劫杀，只好退回。蚩尤与部下商议，正准备再派几名精明强干的士兵前往探查，忽然间天空阴云密布哗哗啦啦地下起了瓢泼大雨。暴雨连降数日，应龙的拦河坝中蓄水已满。应龙便下令掘开大坝，汹涌的河水排山倒海般扑向下游，直奔蚩尤氏的都城。洪水一路披荆斩棘势不可挡，冲毁了蚩尤军营，冲乱了蚩尤军队，冲倒了蚩尤氏的许多民房，人们被突如其来的大洪水吓得惊惶失措，体壮者挣扎着逃命，体弱者皆葬身于水中。轩辕军乘机占据高地，劫杀逃往高地的蚩尤人。蚩尤军伤亡惨重。幸好此时正在山上三个寨子里访问的蚩尤得到消息，率部分军队赶回来救援，同时派人火速赶往桃花寨，请求夸父急速派兵增援。
蚩尤军兵败后逃往阪泉之野。阪泉之野是一个五华里的狭长平川，南北走向，南端有阪泉，是涿水的源头，有沟壑通蚩尤城。此时轩辕军已扼守阪泉之野东面的高地，派六军（熊、虎、罴、貅、貔、?）阻截蚩尤军的去路，幸得夸父和风伯、雨师及罗堰十二国（部落）援军赶到，蚩尤军民才得以脱身。
蚩尤二十五年（丙午，前4515），轩辕氏大酋长姬邦卉决心要灭掉蚩尤氏，他调集了强大的兵力，并联合炎帝神农氏的军队追击和围剿溃败中的蚩尤氏军队。
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